Grande parte do debate recente em torno do 'novo ateísmo' ocorreu dentro de uma visão mal informada da história e filosofia da ciência e sua relação com a religião. A história da ciência é estudada desde os tempos antigos, através da revolução científica moderna, juntamente com as tendências filosóficas em nossa compreensão da realidade. As principais áreas de diálogo entre ciência e religião são exploradas em profundidade, incluindo cosmologia, evolução, ação e milagres divinos, consciência e a pessoa humana.